Puchar Polski 2002/2003, grupa: Małopolski ZPN - Nowy Sącz - Gorlice

II runda:21 lipca
Sokół Krużlowa Wyżna 3-7 LKS Zagórzany
1/4 finału28 lipca
LKS Zagórzany 2-3 Glinik/Karpatia Gorlice

---

Puchar Polski 2003/2004, grupa: Małopolski ZPN - Nowy Sącz - Gorlice

1/4 finału:3 sierpnia
LKS Uście Gorlickie 0-1 Zagórzany
1/2 finału:13 sierpnia
LKS Zagórzany 3-1 KS Biecz
Finał:24 września
Glinik/Karpatia Gorlice 3-1 LKS Zagórzany

---

Puchar Polski 2004/2005, grupa: Małopolski ZPN - Nowy Sącz - Gorlice

II runda:25 lipca
LKS Ropa 4-3 LKS Zagórzany, po dogrywce (po 90 minutach 3-3)

---

Puchar Polski 2005/2006, grupa: Małopolski ZPN - Nowy Sącz - Gorlice

II runda:24 lipca
Moszczanka Moszczeniaca 0-2 LKS Zagórzany
III runda:31 lipca
KS Biecz 0-1 LKS Zagórzany
1/2 finału:7 sierpnia
LKS Zagórzany 2-1 LKS Kobylanka
Finał:9 sierpnia
LKS Zagórzany 0-7 Glinik/Karpatia Gorlice

---

Puchar Polski 2006/2007, grupa: Małopolski ZPN - Nowy Sącz - Gorlice

II runda:23 lipca
Biała Brunary 3-3 LKS Zagórzany, po dogrywce karne 4-2(po 90 minutach 1-1)

---

Puchar Polski 2007/2008, grupa: Małoposki ZPN Nowy Sącz - Gorlice

II runda:29 lipca
LKS Szymbark 0-9 LKS Zagórzany
III runda:5 sierpnia
KS Bobowa 3-4 LKS Zagórzany
1/2 finalu:29 sierpnia
LKS Uście Gorlickie 2-0 LKS Zagórzany

---

Puchar Polski 2008/2009, grupa: Małopolski ZPN - Nowy Sącz - Gorlice

II runda:3 sierpnia
Ogień sękowa 1-0 LKS Zagórzany

---