Historia szkolnictwa we wsi sięga lat 1856-1859, gdy ks. Kacper Winnicki i organista Michał Zawiliński zakładają szkołę. Początkowo mieści się ona w jednej z sal na organistówce. W latach 70-tych XIX w. zostaje zbudowany drewniany budynek szkoły. Powstaje on przy udziale gminy i właściciela pałacu. Rada Szkolna Miejscowa zakupiła od Karola Sopla pół morga wraz z znajdującym się na nim budynkiem. Po przebudowie mieścił jedną sale lekcyjną. Został nazwany "Karolówką". Pierwszym świeckim nauczycielem był Wincenty Wójcikiewicz. Z uwagi na bardzo duże zainteresowanie edukacją, utworzono dodatkową klasę nadetatową. Dzięki otrzymaniu od gminy bezzwrotnego zasiłku z funduszu krajowego w wysokości 18000 koron, w roku 1908 zaczęto wznosić budynek z czterema klasami, kancelarią i mieszkaniem dla kierownika szkoły. Po półrocznej budowie 1 XI 1908 roku został oddany piętrowy budynek a koszt inwestycji wyniósł 30000 koron. Działania wojenne I wojny światowej doprowadziły do zniszczenia budynku i urządzeń "Karolówki". Drugi budynek ocalał dzięki temu, że w czasie wojny pełnił rolę szpitala. Dzięki bardzo dużej pomocy hr. Aleksandra Skrzyńskiego 1 IX 1915 roku zajęcia mogły już się rozpocząć. W marcu 1916r. przeniesiono zwłoki poległych żołnierzy z ogrodu szkolnego na nowo wybudowany cmentarz wojskowy w Zagórzanach. Na mocy rozporządzenia Kuratorium Okręgu Szkolnego Krakowskiego w Zagórzanach powstała szkoła 5-klasowa. Szkoła się rozwijała, powstała: Szkolna Kasa Oszczędności, Spółdzielczy Sklepik Szkolny, Oddział Związku Strzeleckiego, Koło Młodzieży Ludowej. Podczas II wojny światowej budynek szkoły był kilkakrotnie zajmowany przez różne oddziały niemieckie. W czasie okupacji hitlerowcy zniszczyli urządzenia dydaktyczne i wyposażenie szkoły. Po zakończeniu wojny zajęcia rozpoczęły się 10 września 1945 roku z powodu remontu. Coraz większym problemem stawał się brak pomieszczeń. Wprowadzono naukę na dwie zmiany. Postanowiono wybudować nową szkołę. W 1959 roku kopalnia "Wujek" przekazała 10000 cegieł. Młodzież szkolna zebrała 20236 zł. 23 czerwca 1963 roku odczytano uroczyście akt erekcyjny i wmurowano kamień węgielny pod budowę szkoły. Miał to być pomnik 1000-lecia Państwa Polskiego im, Generała Świerczewskiego. 30 sierpnia 1964 roku odbyła się ceremonia otwarcia szkoły. Całkowity koszt inwestycji wyniósł 4825306,55 zł, z czego wkład mieszkańców oszacowano na 1 milion złotych. Nowa szkoła składała się z siedmiu sal, biblioteki, sali audiowizualnej, sali gimnastycznej, pracowni fizyczno-chemicznej, szatni, zaplecza kuchenno-gospodarczego. Budynek starej szkoły został przekazany na potrzeby przedszkola. W 1990 roku mieszkańcy Zagórzan wystąpili z wnioskiem o likwidację imienia szkoły z powodu "udowodnienia niepochlebnych faktów z życia bohatera naszej szkoły". Na początku lat 90-tych dokonano dwóch włamań do szkoły. Niestety lecz nie udało się znaleźć sprawców. 1 września 1999 roku w wyniku przeprowadzonej reformy oświaty powstało w Zagórzanach Gimnazjum obejmujące swym zasięgiem 3 miejscowości: Zagórzany, Kwiatonowice i Stróżówka. Na podstawie uchwały Rady Gminy Gorlice z 31 lipca 2001 roku została połączona Szkoła Podstawowa i Gimnazjum w Zespół Szkół w Zagórzanach.